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ADN ancien ; phylogéographie ; changements climatiques ; diversité génétique
Depuis le début du Quaternaire (-1.8 MA), de courts épisodes de réchauffement d'une dizaine de milliers d'années succèdent tous les 100 000 ans à de longues périodes glaciaires. Au cours du Pléistocène supérieur (-130 000 ans à -10 000 ans), l'Europe était plongée dans sa dernière glaciation. Malgré de courts retours à des conditions plus clémentes, ce n'est qu'au moment où débutait le nouvel interglaciaire (Holocène, -10 000 ans à nos jours), que la température a définitivement remonté. Depuis, à part de rares épisodes rigoureux la température est restée globalement chaude. Grâce à l'ADN ancien préservé dans les fossiles, il est possible d'accéder à de courtes séquences nucléiques de spécimens qui vivaient il y a plusieurs dizaines, voire centaines, de milliers d'années. L'ADN ancien offre donc une chance unique de suivre l'évolution de la diversité génétique des espèces au moment même où ces changements climatiques survenaient et donc d'évaluer directement les répercutions génétiques des variations climatiques. Nous tirerons parti des grandes collections de fossiles retrouvés dans les cavernes européennes pour suivre, à la fois dans l'espace et dans le temps, la diversité génétique d’une espèce aujourd’hui disparue : l'Ours des Cavernes. Les séquences anciennes obtenues serviront à estimer les valeurs de la diversité génétique et de la taille efficace des populations au fil du temps, mais aussi à examiner leurs profils de migration. Le suivi de l'évolution de la diversité génétique de cette espèce au moment de la transition Pléistocène-Holocène illustrera pour la première fois les changements génétiques qui, chez une espèce, accompagnent son extinction.
ADN ancien ; phylogéographie ; changements climatiques ; diversité génétique
Since the beginning of the Quaternary (-1.8 MYr), short warming episodes of ca. 10 000 years, are interrupting every 100 000 years to long glacial periods. During late Pleistocene (-130 000 to -10 000 years BP), Europe was experiencing a glacial period. Even if there were brief warmer periods, it is only when the new interglacial (Holocene, - 10 000 years BP) started that temperature definitively raised in Europe. Since that time, except during very short periods the temperature is relatively hot. Using ancient DNA preserved in fossils it is possible to retrieve short nucleotidic sequences of specimens living 10 to 100 000 years ago. Ancient DNA thus offers the unique possibility to follow the evolution of genetic diversity of model species when climatic changes were occuring and thus to directly follow the impact oft these climatic changes. We will use the vast collections of fossils found in caves to follow in space and time the genetic diversity of a model species : the cave bear. The sequences we will determine will be used to estimate the genetic diversity, the effective size of populations through time but also to examine their migratory profiles. Following the evolution of genetic diversity of these two species during the Pleistocene-Holocene transition will illustrate for the first time the genetic changes that occur during species extinction.